会计实战的老师您好!我是承包工程的和公司签订的有承包协议,因政府欠工程款9年了是16年5月1号营改增以前欠的老款承包时公司是核定征收税,把营业税所得税管理费交齐就行了没有要成本发票,现在政府能付些款但钱到公司账上后又要成本发票才能支出这些款,我该如何办?