我刚到一个建筑公司,他只有劳务资质,现在这这么个情况,在我之前都没有会计。我们公司去年有收到甲方两笔款,甲方也代我们发了几个月工资。我们都没记有账,也没有报个税。要如何处理呢?收款当时没有开具发票给甲方,今年才开。